三磷酸脱氧核苷酸(dNTP):组成和概述

一个类似俄罗斯方块的游戏,代表dNTP

核苷酸是什么?

核苷三磷酸是一种参与构建核酸(DNA和RNA)的生物分子。从结构上讲,它们含有与一个核糖和三个磷酸盐结合的含氮碱基。而且,根据其结构中涉及的核糖的类型,如核糖或脱氧核糖,它们被分为脱氧核糖核苷酸三磷酸(dNTP)或核糖核苷酸三磷酸(NTP)。

Deoxynucleotide三磷酸(核苷酸)核糖核酸是DNA的一个单体单位,由核糖核酸还原酶(RNR)还原核糖核苷酸形成。它含有一个氮碱基,与脱氧核糖结合,还有三个磷酸基连接在它的5 '碳上。

含氮基团可以是杂环嘌呤或嘧啶结构,在DNA扩增过程中支持碱基配对相互作用。这些分子之间的特殊配对使得核酸能够携带遗传信息。

在DNA复制过程中,一个核苷酸的5 '磷酸基通过脱水合成与另一个核苷酸上的3 '碳形成磷酸二酯键。而且,新核苷酸的加入总是发生在3 '端,这意味着DNA合成发生在5 '到3 '端。

根据其结构中所含的含氮碱,dNTP有四种类型:

  • dTTP
  • dCTP
  • dGTP
  • dATP

一个dNTP池中的balance是维持和调节基因组完整性所必需的。因此,基因库中的任何干扰都可能导致突变增加、基因组不稳定和肿瘤发生。

除了作为DNA分子的构建单元,这些dNTPs在不同的生命科学和分子生物学实验室中有许多应用,如克隆、PCR反应和cDNA合成,特别是在诊断和治疗方面。

在本文中,我们将介绍所有四种类型的脱氧核苷三磷酸盐(dATP、dGTP、dTTP和DCTP)以及这些dNTP组件的实验室应用。

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核苷酸的组成部分

三磷酸脱氧核糖核酸(dNTP)是四种类型基于氮基团(腺嘌呤,鸟嘌呤,胸腺嘧啶和胞嘧啶)附着在DNA构建单元。

dTTP

dTTP是DNA合成所需的四种核苷三磷酸之一。它含有胸腺嘧啶作为氮基,在DNA复制过程中与dATP(脱氧三磷酸腺苷)形成两个氢键。

含有核苷三磷酸的胸腺嘧啶主要被称为胸腺嘧啶(而不是脱氧胸腺嘧啶),因为它在转录(mRNA合成)过程中没有任何作用。

生物分子所执行的各种功能包括DNA复制,tRNA合成,以及在细胞周期的G1/早期S期同步细胞。在实验室中,它被用于一系列的分析,包括DNA测序,DNA标记,和cDNA合成。

dCTP

dCTP是一种含胞嘧啶作为含氮碱基的核苷三磷酸。在基因组DNA复制过程中,核苷酸与dGTP形成3个氢键。这些核苷酸之间的键合为DNA结构提供了力量。

核苷酸参与了生物基因组的表观遗传修饰和DNA合成。在实验室中,它被用于测序,下一代测序的文库准备,以及制备包括qPCR、RT-PCR和高保真和远程PCR在内的各种PCR反应的主混合物。

dGTP

dGTP是一种含有鸟嘌呤作为氮基的核苷酸。它是由dGMP通过酶促合成和化学磷酸化合成的。

它在生物体中有一系列的作用,其中包括:

  • DNA合成。
  • 在疱疹病毒治疗中作为病毒复制的抑制剂。
  • 在核苷酸合成中作为底物的

在分子生物学实验室中,它被用于包括qPCR、微阵列、多重PCR、定点突变、基因分型和分子克隆在内的各种分析。

dATP

dATP是DNA的四个组成部分之一。它的分子量为491.1816 g/mol,结构上由一个腺嘌呤碱、一个脱氧核糖糖和三个磷酸组成。

这种分子有几种作用,包括在活的有机体内在大肠杆菌和小鼠中充当代谢物,并抑制人核糖核酸还原酶。

在实验室中,它与其他试剂一起用于进行一系列实验室分析,包括PCR扩增、全基因组测序、DNA标记和跟踪。

核苷酸的应用

dNTP是分子生物学和其他生命科学实验室的重要试剂。它用于准备主混合物,需要与其他试剂一起进行一些实验,包括Taq DNA聚合酶,模板DNA和缓冲液。

科学家们要么自己通过添加单独的dATP、dGTP、dCTP和dTTP来准备dNTP混合物,要么从商业供应商那里购买dNTP混合物。DNTP浓度和测定中使用的试剂根据要进行的实验不同而不同。

之前购买商用dNTP混合料,确保有效产品的纯度经HPLC确认为>99%。此外,它应该没有任何污染物,如PCR抑制剂,DNA酶,rna酶,人类和大肠杆菌DNA。

下面给出了在实验室中广泛执行并使用dNTP混合物的检测结果。

聚合酶链反应

聚合酶链反应(PCR)是一种利用DNA聚合酶,如Taq聚合酶,将DNA片段复制成数百万个副本的技术。

在实验中,dNTP利用PCR延伸阶段的模板DNA形成新的DNA链。

该检测方法被用于许多下游应用,包括基因定位、法医、疾病筛查、疾病诊断和基因指纹。

DNA合成

在DNA合成过程中,dNTPs作为一个单元从模板链合成一个互补的DNA链。这些碱基被提供给解压缩的DNA以复制信息。

DNA标签

dntp被用于一系列的DNA标记实验,如:

  • DNA 5 '末端标记(使用多核苷酸激酶和atp - γ - 32p)
  • DNA 3 '末端标记(使用末端转移酶和三磷酸脱氧核苷酸)
  • 标记单核苷酸终止子
  • 随机引物扩展标记
  • 尼克翻译标签

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脱氧核苷酸三磷酸指的是四种核苷酸(dATP, dGTP, dTTP和dCTP),它们在生物体中参与了DNA的合成。

在复制过程中,核苷酸被添加到未压缩的DNA中以形成新的互补链。两条链上的核苷酸通过氢键相互配对,形成双链螺旋。

dNTP在实验室中被用于大量的应用,包括DNA测序,DNA标记,cDNA合成和基因组DNA扩增。

为了保证实验的完整性,需要一个高质量、纯净的dNTP。然而,,先进仪器执行这些高通量分析也需要工具。

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