NGS -下一代测序器:

NGS -下一代测序器

下一代测序如何工作?我们的服务如何节省时间和金钱

万博全站登录Excedr生物技术/生命NGS -下一代测序器

无论您的设备需求可能是什么,Excedr的租赁计划几乎可以采购任何类型的设备,并能够满足终端万博全站登录用户可能拥有的无数品牌偏好。今天就联系我,看看租赁如何为你节省时间和金钱。

所有设备品牌/型号均可提供

Excedr的好处万博全站登录门店租赁计划:

  • 通过将成本随时间分摊,消除了购买设备的前期成本
  • 最小化设备停机,包括完整的维修覆盖和预防性维护
  • 利用潜在的100%免税*支付,为您提供大量的现金节省
  • 加快仪器采购和后勤所需的行政工作
  • 节省营运资金,使您能够将资金再投资于核心业务和运营(员工、库存、营销/销售等)。
  • 适应所有制造商和型号首选项

*请向您的税务顾问咨询,以确定租赁设备的全部税务影响。

当人类基因组计划(HGP)在1990年启动时,目标是在15年内确定整个人类色素基因组的DNA序列。

许多人对该项目持怀疑态度,因为该项目的巨大成本似乎超过了潜在的收益。最终,研究人员花了10年时间和30亿美元完成了这个项目。

然而,它被广泛认为是一个巨大的成功,并开创了一个新的医学时代。该项目的完成还导致了用于DNA测序的测序技术类型的关键进步。

几年后,下一代测序技术(NGS)的出现带来了一种截然不同的DNA测序方法。它大大降低了整个人类基因组测序的成本和时间,并且,通过技术的进步,允许有针对性的DNA富集方法,可以在每个样本的成本更低的情况下执行更高的基因组吞吐量。

过去需要数年和数百万美元才能完成的工作,现在只需要几千美元和一两天的时间,这取决于测序的平台和基因组的大小。

自引入以来,NGS技术已被用于确定DNA或RNA的序列(RNA-seq),通过DNA片段(扩增子测序)、文库制备和测序,研究与疾病或其他生物现象相关的遗传变异。所有这些都是大规模的。直到今天,它仍在以前所未有的速度发展。

最初被称为“大规模并行测序”,这种高通量测序方法允许科学家:

  • 对单个基因组进行大量常规检查和测序(全基因组测序)
  • 观察个体基因的变化
  • 利用全外显子组测序研究基因或生物标记物的群体变异
  • 研究微生物组和宏基因组学
  • 以更高的准确性、灵敏度和速度将癌症基因组与健康基因组区分开来(对肿瘤学领域产生重大影响)
  • 研究表观基因组,为许多物种和细胞类型的表观遗传修饰提供全面的观点。
  • 研究个性化医疗的可能性

此外,RNA-seq的发展在很大程度上归功于NGS的成功。得益于长读和直接RNA-seq技术的创新,以及用于数据分析的先进计算工具,它增加了科学家和研究人员对RNA生物学、基因表达和转录组的理解。

此外,它还允许从头测序和组装,这是在对一个新的基因组进行测序时使用的,没有可用的参考序列。

下一代测序方法,分析,应用等

不管具体的方法是什么,下一代测序器都依赖于从被查询的复杂基因组中生成具有代表性的、无偏倚的核酸模板源。DNA模板或单个DNA分子的克隆扩增,在流式细胞中以大规模并行的方式进行测序。

测序是通过逐步迭代过程或连续实时方式进行的。通过这种方式,这些仪器可以在一次反应中对多达数十亿个单独的DNA模板进行测序。

NGS平台和第二代测序平台主要有几家供应商。这其中包括Illumina, Thermo Fisher Scientific, Oxford Nanopore Technologies, Roche和Agilent等公司。它们都有相同的基本测序过程,但技术不同。

让我们来看看目前正在使用的各种方法和技术。

半导体技术
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转换成半导体芯片上的数字信息(0,1),类似于你在数码相机中可能发现的那个。有些系统本质上是世界上最小的固态pH值计,用来测定DNA序列。

DNA被碎片化,附着在珠子上,沉积在芯片表面数百万个孔中。然后,这些孔被一个接一个的核苷酸依次注入。

如果一个核苷酸加入到珠状结合的DNA链中,一个氢离子就会释放出来,井下的离子传感器就会测量出化学变化,碱基就被称为碱基。

这一过程同时在数百万口井中进行,只需数小时就能完成测序。


结扎技术
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DNA连接酶用于确定目标DNA分子的潜在序列。荧光标记的二基探针与与引物模板相邻的互补序列杂交。

然后,在加入DNA连接酶后,将染料标记的探针连接到引物上。未结扎的探针被冲走,并使用荧光成像识别结扎的探针。

使用两种不同的引物,通过两个独立的连接反应有效地探测每个碱基。


单分子实时技术
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在SMRT技术中,DNA聚合酶将自己连接到要复制的DNA链上,检查连接点上的单个碱基,然后确定四个构建块(或核苷酸)中哪一个需要复制该单个碱基。

在确定需要哪个核苷酸后,聚合酶将该核苷酸合并到正在生成的生长链中。

合并后,酶进入下一个被复制的碱基,然后重复这个过程。


合成技术测序
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测序模板固定在一个专有的流式细胞表面,该表面旨在以一种方便酶访问的方式呈现DNA,同时确保表面结合模板的高稳定性和荧光标记核苷酸的低非特异性结合。

固相扩增可以近距离生成1000个模板分子的相同拷贝,形成一个簇,因为这个过程不需要将珠珠定位到井中或机械斑点,因此可以实现更高的密度。

SBS技术使用四个荧光标记核苷酸,使用专有的基于可逆终止器的方法,在流细胞表面并行排列数千万个簇。

这使得当单个碱基被合并到生长的DNA链中时,能够被检测出来。由于在每个测序周期中,所有四个可逆的终止端结合dntp都存在,自然竞争将合并偏差最小化。

结果是碱基对碱基的排序,为广泛的应用提供了高度精确的数据。


纳米孔技术
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纳米孔技术是目前正在开发的一种令人兴奋的新方法。

该技术记录了核酸通过合成纳米孔或蛋白质纳米孔时电流的特征变化,理论上可以一步完成完整染色体的测序,而不需要生成新的DNA链。


NGS vs.桑格测序
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NGS可以与许多现有的测序技术进行比较,如微阵列、定量PCR (qPCR)和Sanger测序。然而,NGS和Sanger测序通常是比较最多的。虽然两者在原理上是相似的,但它们之间的主要区别是每种方法的排序体积。

这两种技术都使用DNA聚合酶将荧光核苷酸逐个添加到生长的DNA模板链上,以便用荧光标记识别合并的核苷酸。然而,桑格测序被一些人认为是DNA测序技术的黄金标准,一次只能对单个DNA片段进行测序。另一方面,NGS每次运行可以对数百万段进行排序。

如今,NGS经常与桑格测序相结合。由于它具有较高的准确性,常被用于验证NGS结果。Sanger和下一代测序方法都被用于当今许多实验室的基因分析,因为这两种方法实际上可以相互支持,产生更准确和可靠的结果。


生物信息学与临床应用
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虽然NGS被认为是一种用于整个生命科学研究应用的成熟分析技术,但分析工作流程仍然需要大量的生物信息学专业知识。

生物信息学,在基因组学和分子病理学的背景下,使用计算、数学和统计工具来收集、组织和分析大型和复杂的基因测序数据和相关的生物学数据。

建立大规模分析工作流程的一些常见挑战包括适当选择分析软件工具,使用高性能计算并行化和加速技术加速整个过程,开发自动化策略,数据存储解决方案,开发跨多种实验条件充分利用分析结果的方法。

最近,NGS已经开始扩展到临床环境,在那里它帮助诊断,实现个性化治疗方法。针对癌症患者最常见的NGS检测方法之一是定向面板测序,它通常会检查数百个目标基因。

测序仪产生大量定量和复杂的测序数据,许多临床实验室依赖这些数据来识别与临床相关的基因改变。在当今的临床环境中,创建一个资源密集型的数据处理管道来分析所有生成的NGS数据已经成为必要的。

生物信息学CRO与Excedr合作,为各种规模的实验室提供端到端生物信息学服务。万博全站登录如果您正在寻找租赁下一代测序仪,并预见到需要一个生物信息学团队,不必再寻找了。从实验设计到最终分析,生物信息学CRO可以提供帮助。


下一代测序技术租赁

如果您有兴趣购买下一代测序器,但希望避免花费大量的前期资金,可以考虑租赁NGS技术。

租赁最前沿的实验室设备不能提供使用顶级仪器的机会,它还可以帮助您更容易地管理现金流,并为其他重要领域节省预算空间,如雇用更多的人才或购买昂贵但必要的消耗品。

此外,如果您正在考虑集成单元格排序技术,并希望租用一个流式细胞分析仪(并使用它与您的音序器相结合),我们可以帮助。

达到我们+ 1 888-927-3802或者填写我们的联系方式,我们可以详细讨论您的具体需求。

经营租赁

这种表外融资结构在期限结束时提供了三种选择。承租人有权选择将设备归还出租人,以折扣率更新,或以公平的市场价值购买仪器。每月支付也是100%的税收减免,产生额外的货币储蓄。

售后回租

如果您最近购买了设备,Excedr可以为您的设备提供现金,并将您的购万博全站登录买转换为长期租赁。这叫做售后回租。如果您在过去90天内支付了设备费用,我们可以帮助您收回投资,并允许您按月支付较低的金额。这也节省了你的预算,而不是把钱绑在固定资产上。


市场上的下一代音序器制造商和型号
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Illumina公司:
MiniSeq, MiSeq, NextSeq, HiSeq, HiSeq X, NovaSeq

ThermoFisher & Life科技:
离子激流,离子PGM,离子质子,离子S5,离子S5 XL

牛津纳米孔技术:
MinION, PromethION, GridION X5, SmidgION

太平洋生物科学:
PacBio RS II, PacBio后续系统

试剂盒:
GeneReader NGS系统,GeneRead, QIAseq

Fluidigm:
朱诺

和更多!



营运资金的好处

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万博全站登录Excedr的运营租赁结构允许您保持业务信用额度的开放,以用于扩张、人员配备和其他运营费用。此外,它加强了你的企业的现金流,并保持现金储备的自由为业务发展机会。

对信用的影响

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租赁为您提供非稀释性融资,不妨碍您未来的借款能力。你可以获得你所需要的设备,而不需要背负传统融资的包袱。

使用设备

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与传统的融资和租赁公司不同,Excedr项目除了演示单元外,还可以容纳翻新/翻新设备。万博全站登录如果您正在寻找额外的成本节省,我们建议考虑这个选项。

批准的速度

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