脱氧鸟苷三磷酸(dGTP)是什么?

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什么是dGTP?

脱氧鸟苷三磷酸(dGTP)是一种具有嘌呤碱基(鸟嘌呤)、脱氧核糖和三个磷酸基的核苷酸。它是DNA合成所需的四种dNTPs(脱氧核苷三磷酸)之一,另外还包括:

每一个脱氧核苷三磷酸,包括dGTP,形成一个磷酸二酯键,形成新的DNA链,使用DNA聚合酶和精力。

dGTP除了作为DNA复制的基石外,还在一些生物过程中作为代谢物,并在分子生物学、生物化学和生物化学中作为必要的原料03manbetx.com 执行在体外生化反应,如PCR

dGTP也被称为2 ' -脱氧鸟苷-5 ' -三磷酸,2 ' -脱氧鸟苷三磷酸和脱氧- gtp。其分子式为C10H16N5O13P3,分子量为507.181 g/mol。

dGTP合成

dGMP作为合成dGTP的前体。该过程通过两种方法进行,要么通过酶合成,要么通过化学磷酸化。

  • 酶的合成:在这个过程中,高度特异性的酶被用来进行磷酸化过程.在这个过程中没有额外的纯化步骤,所有的杂质(如焦磷酸盐和修饰的核苷酸)和PCR抑制剂(如脱氧核苷四磷酸盐)都被消除了。
  • 化学磷酸化:这是在不使用酶的情况下将磷酸基添加到dGMP的过程。它需要在核苷酸生产后进行额外的纯化步骤,以消除杂质和微量化合物,如PPi、脱氧核苷二磷酸盐和其他离子化合物,如乙酸。

在这篇文章中,我们将介绍dGTP的功能,它如何执行这些功能,它的结构特征,以及它与GTP(鸟苷三磷酸)的不同之处。

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dGTP vs GTP

dGTP和GTP的区别主要在于结构方面。然而,这个参数也在功能上将它们分开。

dGTP和GTP之间的一些显著差异包括:

dGTP

三磷酸鸟苷

1. 它含有脱氧核糖。

它含有核糖。

2. 其分子式为C10H16N5O13P3。

其分子式为C10H16N5O14P3。

3. 它没有羟基
它位于糖的2 '位置。

它有一个羟基
它位于糖的2 '位置。

4. 它是DNA复制的基本底物。

它是转录的重要组成部分。

5. 它参与了DNA的合成。

它参与了RNA的合成。

6. 除了参与
复制过程中,它起作用
作为某种生物的代谢物
过程,包括嘌呤代谢和硫鸟嘌呤作用途径。

它的功能包括能量传递
在细胞中(可以很容易地转化为ATP),
遗传翻译,不稳定性在
微管动力学,和线粒体中蛋白质的易位。

7. 分子dGTP结构 分子GTP结构

dGTP是如何工作的?

dGTP含有三个磷酸基,α, β和γ磷酸。它们由高能磷酸酐键连接在一起。

在体外DNA扩增或在活的有机体内DNA合成发生时,两个磷酸基被移除,碱基被纳入新的核酸链。

在DNA合成过程中,两个磷酸盐,α和β在反应中被去除,导致dGMP(脱氧鸟苷单磷酸)的形成。除去的PPi基团为DNA聚合酶提供能量,将即将到来的核苷酸添加到新合成的DNA链中。

dGMP的5 '磷酸基与生长链核苷酸的3 '羟基结合。这导致两个核苷酸之间形成磷酸二酯键。

dGTP的用途是什么?常见的应用程序

dGTP是一种核苷三磷酸,在生物和生物中具有广泛的作用和用途在体外实验室工作流程。

在生物

  • dGTP是DNA合成的基石。
  • 它是治疗HSV中抑制病毒复制开始的阿昔洛韦的竞争对手之一。
  • 它也是由核糖核苷酸还原酶调节脱氧核苷酸合成的底物。
  • 它作为一种代谢物在生物的几个生物过程中,包括大肠杆菌(大肠杆菌),人类,老鼠,拟南芥等等。它包括硫唑嘌呤作用途径,硫鸟嘌呤作用途径,巯基嘌呤作用途径,嘌呤代谢。
  • 它作为四聚体SAMHD1脱氧核苷三磷酸三磷酸水解酶的变构激活剂。dGTP结合在酶的活性位点,导致酶的一些构象变化和激活。

在分子生物学实验室

为了进行实验室实验,一个优秀的dGTP是必不可少的,因为低质量的试剂会破坏整个工作流程。因此,有必要参考卖方提供的文件,如分析证书、产品信息表、安全数据表(SDS)和其他用户指南。

此外,检查质量对于产品,要注意以下几点:

  • 产品纯度99%,经HPLC (a色谱法技术)。
  • 它是免费的大肠杆菌或者人类DNA。
  • 产品高度稳定。

市场上有一系列纯净和改性形式的dGTP,有助于许多实验室分析,以及其他试剂,其中包括其他dntp (dATP, dCTP和dTTP),三盐酸缓冲液,引物,DNA聚合酶酶,EDTA和其他化学底物。

实验用的dGTP溶液是通过将dGTP溶解在10 mM-50 mM的tris缓冲液中制备的(如产品用户手册所示)。

dGTP的一些应用包括:

  • dGTP用于几种实验室分析,包括:
  • 聚合酶链反应
  • rt - pcr
  • DNA测序
  • DNA标签
  • 重组DNA的分子克隆/合成
  • 基因组测序
  • 微阵列
  • qPCR
  • 互补脱氧核糖核酸的合成
  • 定点诱变
  • 远程PCR
  • 基因分型
  • DHPLC
  • 它的模拟,7-Deaza-dGTP,用于在体外测序技术可以提高模板DNA富含GC含量时的PCR产量。

dGTP结构

脱氧鸟苷三磷酸是一种具有鸟嘌呤碱基(嘌呤)的核苷三磷酸,由磷酸酐键连接的三个磷酸基和脱氧核糖。脱氧核糖在糖环的2 '位置上不含羟基。

dGTP的CAS号为2564-35-4。这个数字是用来为化学物质提供唯一的识别,不会被任何其他化合物搞错。

dGTP的分子结构

图:dGTP的结构示意图。

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dGTP是一种嘌呤基核苷酸,在DNA合成中有应用。此外,它在几种生物中作为代谢物,并促进某些生物过程,如嘌呤代谢。

该化合物还用于实验室进行一系列应用,如标准PCR、远程PCR、DNA标记和测序。所有这些程序都有助于科学家了解生物体的代谢过程,并更好地了解它们的生活方式。

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