什么是DCTP?定义与用例

DCTP结构。

什么是脱氧胞苷三磷酸(DCTP)?

2'-脱氧胞苷5'-三磷酸(或DCTP)是核苷三磷酸(核苷酸),含有胞嘧啶作为其嘧啶碱。它还具有附着在三个磷酸盐单元上的脱氧糖。它的化学式是c9.H16.N.3.O.13.P.3.分子量为467.1569g / mol。化合物的CAS数为2056-98-6 - 该数字由化学摘要服务(CAS)给出,以直接提及化合物的信息。

在双链DNA中,DCTP与DGTP配对,形成三个氢键,而DATP.dttp.通过形成两个氢键来制造一对。因此,链中的GC含量有助于结构的稳定性,并确定其物理性质,例如其熔化温度。

胞嘧啶的一些其他衍生物(例如在脱硫酸氢盐处理后形成的甲基化和DUTP之后形成的5-甲基 - 胞嘧啶),也具有在生物体中进行的基本作用。

亚硫酸氢盐处理和甲基化敏感性限制酶(有或没有甲基化处理)是用于检测基因组DNA中DCTP的甲基化的两种方法。

本文提供了DCTP的完整概述及其在其他生物的实验室和身体中的用途。此外,它涵盖了其结构表示及其工作机制。

万博全站登录Excedr租赁设备和完全服装的研究实验室工作紧缩预算。如果这听起来像你,租赁您需要的尖端实验室设备并为其他关键的行动领域省钱。

DCTP使用案例和功能

DCTP(包括其他DNTP等DNTP,例如DATP,DGTP,DCTP和DGTP)在身体和分子生物学实验室内部有几种用途。基本上,它们有助于确定生物体代谢功能的工作机制。此外,它们还用于研究生物体的演变或将任何新物种的分类到特定家庭(通过DNA测序)。

下面解释DCTP的一些额外用途和功能:

  • 在实验室中,DCTP(和其他DNTPS)用于测序,克隆,cDNA合成和文库制剂等测定下一代测序
  • 为DCTP浓度约为100mM溶液(在水中)体外PCR,逆转录,RT-PCR.,实时PCR,高保真和DNA标记反应(除了其他试剂和耗材,包括模板DNA,基因特异性引物对,DNTP混合物,TRIS缓冲液,水,热阻载辊和PCR管)。
  • 染料DCTP用于微阵列,原位杂交,和阐述应用程序产生标记的DNA探针。
  • 在生物体中,它用于合成DNA(脱氧核酸)。
  • 它也涉及几种生物过程中的代谢物,包括二氢嘧啶酶缺乏,β脲丙基酶缺乏,嘧啶代谢,UMP合酶缺乏和线粒体神经元缺乏症脑病。

在碳五中修饰的胞嘧啶是一个重要的表观遗传修饰,具有一系列角色。其在生物体中的一些功能是:

  • 改性化合物用作十一十一易位(TET)酶系列的底物和相关氧化途径。
  • 除了能够产生完全甲基化的胞嘧啶取代的DNA之外,还可以使用5-甲基-DCTP用于各种生物化学和细胞功能。
  • 在Milli-Q™水中以10mM溶液制备5-甲基-DCTP的溶液,吸光度为260nm以测量核苷酸浓度。

在大多数实验室工作流中使用的商业上可用的DCTP可以存储在-20摄氏度。它还强烈建议参考材料和安全数据表(MSDS或SDS),了解您正在购买实验的DCTP核苷酸的质量。

此外,确保数据表突出了这四项品质:

  • 化合物的高稳定性。
  • 纯度等于或超过99%。
  • 使用HPLC测试。
  • 没有人和大肠杆菌脱氧核糖核酸。

DCTP如何工作?

DCTP含有三种通过磷酸酐键连接在一起的磷酸盐。这些高能酸酐键释放能量正在进行水解(使用水用于在分子之间破坏一个或多个化学键的反应)。

在DNA复制期间,由于酶,DNA聚合酶,将DCTP(和其他DNTPS)添加到新合成的DNA链中,利用由于高能量键的破裂而释放的能量。

(DNA)N + DCTP↔(DNA)N-C + PPI

在DNA合成过程中:

  • 溶解焦磷酸盐键(其中两个磷原子的PPI)脱落。
  • 粘合的破裂导致形成核苷的单磷酸酯。
  • 单核苷核苷掺入新形成的DNA的3'末端。

DCTP如何掺入DNA,以及其他DNTPS?

DCTP是形成DNA结构的四种DNTP(脱氧核苷酸三磷酸三磷酸盐)中的一种(以及核糖糖和三磷酸)。

  • DNA在5'到3'方向上形成。
  • 所有进入的基础都被添加到生长链的3'末端。
  • DNA的3'末端含有羟基,并且在遇到核苷酸三磷酸核苷酸时,该羟基发出α磷酸酯基团。
  • 由于3'-OH替代β和γ磷酸盐,从复合物中喷射焦磷酸分子。
  • 在生长的子链和下一个核苷酸之间形成磷酸二酯键。
  • 然后反应重复,并以相同的方式,将随后的含氮碱添加到生长链中。

DCTP结构

DCTP由嘧啶胞嘧啶碱,戊糖(Deoxyibose)和三个磷酸基团组成。

首选iupac名称-A基于其结构和化学成分给予Iupac的化合物的名称是:

[(2R,3S,5R)-5-(4-氨基-2-氧嘧啶-1-基)-3-羟基恶魔-2-基]甲氧基 - 羟基磷酸磷酸磷酸膦

数字:脱氧胞苷三磷酸(DCTP)的二维结构表示。

DCTP结构

CTP(三磷酸三磷酸胞嘧啶)不应与DCTP(脱氧胞苷三磷酸)混淆。三磷酸三磷酸含有羟基含有羟基的位置,而脱氧胞苷三磷酸含有脱氧糖(其2'Position的氢原子,而不是羟基)。CTP用于形成RNA,而DCTP用于DNA。

通过Excedr采购您的研发实验室需求万博全站登录

脱氧胞苷三磷酸(DCTP)是由胞嘧啶,脱氧糖糖和三个磷酸基团组成的核苷基础。它涉及形成DNA结构,以及其他含氮碱,包括腺嘌呤,鸟嘌呤和胸腺嘧啶。

分子还可作为若干代谢途径的代谢物,并参与某些疾病。它也用于在体外分子生物学工作流程中的实验室中使用,包括PCR,DNA测序和核苷酸浓度的测定。

结合高质量的实验室级试剂尖端设备提高研究人员数据和结果的质量,再现性和可靠性。在Ex万博全站登录cedr,我们帮助研究人员以此为自己的实验室。

如果您正在进行预算,我们的租赁计划可以帮助您获得应有的技术和设备。立即获取您的定制租赁解决方案。

Baidu
map