什么是三磷酸(DGTP)是什么?

三磷酸(DGTP)分子结构。

什么是DGTP?

脱氧三磷酸(DGTP)是具有嘌呤碱(鸟嘌呤),脱氧核糖糖和三个磷酸基团的核苷酸。这是DNA合成所需的四个DNTP(三磷酸脱氧核苷)之一,以及:

每种脱氧核苷三磷酸盐,包括DGTP,都形成磷酸二酯键,以形成新的DNA,并使用DNA聚合酶和能量。

除了充当DNA复制中的基础外,DGTP还充当多种生物过程中的代谢物,并且是分子生物学,生物化学和分子生物学中必不可少的原材料03manbetx.com 去表演体外生化反应,例如PCR

DGTP还提到使用2'-脱氧的名称,5'-三磷酸,2'-脱氧鸟苷三磷酸和脱氧-GTP。它的分子公式为C10H16N5O13P3,分子量为507.181 g/mol。

DGTP合成

DGMP充当DGTP合成的前体。该过程是通过两种方法通过酶促合成或化学磷酸化发生的。

  • 酶合成:在此过程中,高度特定的酶用于执行磷酸化过程。在该过程中没有其他纯化步骤,并且消除了所有杂质(例如焦磷酸盐和修饰核苷酸)和PCR抑制剂(例如,脱氧核苷四磷酸)。
  • 化学磷酸化:这是在不利用酶的情况下将磷酸基团添加到DGMP中的过程。在产生核苷酸后,它需要额外的纯化步骤,以消除杂质和痕量化合物,例如PPI,脱氧核苷二磷酸盐和其他离子化合物,例如乙酸。

在本文中,我们将介绍DGTP的功能,如何执行这些功能,其结构特征以及它与GTP(三磷酸鸟苷)的不同。

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DGTP与GTP

DGTP和GTP主要在结构方面彼此不同。但是,此参数还将它们分开在功能基础上。

DGTP和GTP之间的一些显着差异包括:

DGTP

GTP

1。 它含有脱氧核糖糖。

它含有核糖糖。

2。 它的分子公式是C10H16N5O13P3。

它的分子公式是C10H16N5O143。

3。 它没有羟基
糖的2'位置。

它有一个羟基
糖的2'位置。

4。 这是DNA复制的必要底物。

这是转录的重要组成部分。

5。 它参与了DNA的合成。

它参与了RNA的合成。

6。 除了参与
复制过程,它起作用
作为某些生物学的代谢产物
过程,包括嘌呤代谢和硫代动作途径。

它的功能包括能量传输
在细胞中(可以容易转换为ATP),
遗传翻译,不稳定
微管动力学和线粒体中蛋白质的转运。

7。 分子DGTP的结构 分子GTP的结构

DGTP如何工作?

DGTP包含三个磷酸基,α,β和γ磷酸盐。它们通过高能量磷酸氢化物键将它们连接在一起。

什么时候体外DNA扩增或体内脱氧核糖核酸发生合成,将两个磷酸基被去除以在新的核酸链中掺入碱。

在DNA合成过程中,在反应中除去了两种磷酸盐,α和β,导致DGMP形成(脱氧瓜诺糖苷一磷酸)。去除的PPI组为DNA聚合酶提供了能量,将即将到来的核苷酸添加到新合成的DNA链中。

DGMP的5磷酸组与生长链的核苷酸的3'羟基相连。这导致在两个核苷酸之间形成磷酸二酯键。

DGTP使用了什么?常见应用

DGTP是一种三磷酸核苷,在生物体中具有广泛的作用和用途体外实验室工作流程。

在生物体中

  • DGTP充当DNA合成的基础。
  • 它是针对阿昔洛韦的竞争者之一,用于抑制HSV治疗中病毒复制的发作。
  • 它也是通过核糖核苷酸还原酶调节脱氧核苷酸合成的底物。
  • 它在生物体的几个生物过程中充当代谢物,包括大肠杆菌(e.coli),人类,老鼠,拟南芥,还有许多其他。它包括硫唑嘌呤动作途径,硫代氨酸动作途径,胃嘌呤动作途径和嘌呤代谢。
  • 它充当四聚体SAMHD1脱氧核苷三磷酸三磷酸化酶的变构激活剂。DGTP在酶的活性位点结合,从而导致酶的某些构象变化和激活。

在分子生物学实验室

为了进行实验室实验,出色的DGTP是必不可少的,因为质量差可能会破坏整个工作流程。因此,有必要参考文件,例如分析证书,产品信息表,安全数据表(SDS)以及卖方提供的其他用户指南。

此外,检查质量在产品中,寻找以下几点:

  • 该产品具有99%的纯度,由HPLC确认(a色谱法技术)。
  • 没有e.coli或人类DNA。
  • 该产品高度稳定。

市场上有一系列纯和修改形式的DGTP,可以在许多实验室测定中以及其他试剂以及包括其他DNTP(DATP,DCTP和DTTP),TRIS-HCL缓冲液,引物,DNA多聚合酶酶酶的其他试剂以及其他试剂中提供。,EDTA和其他化学底物。

通过将DGTP溶解在10 mm-50 mm的TRIS缓冲液中(由产品用户手册的指导)来制备用于实验的DGTP解决方案。

DGTP的某些应用是:

  • DGTP用于多个实验室测定中,包括:
  • pcr
  • RT-PCR
  • DNA测序
  • DNA标记
  • 重组DNA的分子克隆/合成
  • 基因组测序
  • 微阵列
  • qpcr
  • cDNA合成
  • 定向诱变
  • 远程PCR
  • 基因分型
  • DHPLC
  • 它的类似7-deaza-dgtp,被使用体外当模板DNA富含GC含量时,测序技术以提高PCR产量。

DGTP结构

三磷酸脱氧鸟苷是三磷酸核苷,具有鸟嘌呤碱(嘌呤),三个由磷酸甘氨酸氢键和脱氧核糖糖连接的磷酸基团。脱氧核糖不包含糖环2'位置的羟基。

DGTP的CAS数为2564-35-4。该数字用于为化学物质提供唯一的识别,而不会被任何其他化合物误认为。

DGTP的分子结构

数字:DGTP结构的例证。

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DGTP是一种基于嘌呤的核苷酸,在DNA合成中应用。此外,它在几种生物体中充当代谢产物,并促进了某些生物学过程,例如嘌呤代谢。

该化合物还用于实验室,以执行一系列应用,例如标准PCR,远程PCR,DNA标记和测序。所有这些程序都可以帮助科学家了解生物的代谢过程,并更好地了解其生活方式。

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