什么是三磷酸(DGTP)是什么?
什么是DGTP?
脱氧三磷酸(DGTP)是具有嘌呤碱(鸟嘌呤),脱氧核糖糖和三个磷酸基团的核苷酸。这是DNA合成所需的四个DNTP(三磷酸脱氧核苷)之一,以及:
每种脱氧核苷三磷酸盐,包括DGTP,都形成磷酸二酯键,以形成新的DNA,并使用DNA聚合酶和能量。
除了充当DNA复制中的基础外,DGTP还充当多种生物过程中的代谢物,并且是分子生物学,生物化学和分子生物学中必不可少的原材料03manbetx.com 去表演体外生化反应,例如PCR。
DGTP还提到使用2'-脱氧的名称,5'-三磷酸,2'-脱氧鸟苷三磷酸和脱氧-GTP。它的分子公式为C10H16N5O13P3,分子量为507.181 g/mol。
DGTP合成
DGMP充当DGTP合成的前体。该过程是通过两种方法通过酶促合成或化学磷酸化发生的。
- 酶合成:在此过程中,高度特定的酶用于执行磷酸化过程。在该过程中没有其他纯化步骤,并且消除了所有杂质(例如焦磷酸盐和修饰核苷酸)和PCR抑制剂(例如,脱氧核苷四磷酸)。
- 化学磷酸化:这是在不利用酶的情况下将磷酸基团添加到DGMP中的过程。在产生核苷酸后,它需要额外的纯化步骤,以消除杂质和痕量化合物,例如PPI,脱氧核苷二磷酸盐和其他离子化合物,例如乙酸。
在本文中,我们将介绍DGTP的功能,如何执行这些功能,其结构特征以及它与GTP(三磷酸鸟苷)的不同。
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DGTP与GTP
DGTP和GTP主要在结构方面彼此不同。但是,此参数还将它们分开在功能基础上。
DGTP和GTP之间的一些显着差异包括:
DGTP |
GTP |
|
1。 | 它含有脱氧核糖糖。 |
它含有核糖糖。 |
2。 | 它的分子公式是C10H16N5O13P3。 |
它的分子公式是C10H16N5O143。 |
3。 | 它没有羟基 糖的2'位置。 |
它有一个羟基 糖的2'位置。 |
4。 | 这是DNA复制的必要底物。 |
这是转录的重要组成部分。 |
5。 | 它参与了DNA的合成。 |
它参与了RNA的合成。 |
6。 | 除了参与 复制过程,它起作用 作为某些生物学的代谢产物 过程,包括嘌呤代谢和硫代动作途径。 |
它的功能包括能量传输 在细胞中(可以容易转换为ATP), 遗传翻译,不稳定 微管动力学和线粒体中蛋白质的转运。 |
7。 | 分子DGTP的结构。 | 分子GTP的结构。 |
DGTP如何工作?
DGTP包含三个磷酸基,α,β和γ磷酸盐。它们通过高能量磷酸氢化物键将它们连接在一起。
什么时候体外DNA扩增或体内脱氧核糖核酸发生合成,将两个磷酸基被去除以在新的核酸链中掺入碱。
在DNA合成过程中,在反应中除去了两种磷酸盐,α和β,导致DGMP形成(脱氧瓜诺糖苷一磷酸)。去除的PPI组为DNA聚合酶提供了能量,将即将到来的核苷酸添加到新合成的DNA链中。
DGMP的5磷酸组与生长链的核苷酸的3'羟基相连。这导致在两个核苷酸之间形成磷酸二酯键。
DGTP使用了什么?常见应用
DGTP是一种三磷酸核苷,在生物体中具有广泛的作用和用途体外实验室工作流程。
在生物体中
- DGTP充当DNA合成的基础。
- 它是针对阿昔洛韦的竞争者之一,用于抑制HSV治疗中病毒复制的发作。
- 它也是通过核糖核苷酸还原酶调节脱氧核苷酸合成的底物。
- 它在生物体的几个生物过程中充当代谢物,包括大肠杆菌(e.coli),人类,老鼠,拟南芥,还有许多其他。它包括硫唑嘌呤动作途径,硫代氨酸动作途径,胃嘌呤动作途径和嘌呤代谢。
- 它充当四聚体SAMHD1脱氧核苷三磷酸三磷酸化酶的变构激活剂。DGTP在酶的活性位点结合,从而导致酶的某些构象变化和激活。
在分子生物学实验室
为了进行实验室实验,出色的DGTP是必不可少的,因为质量差可能会破坏整个工作流程。因此,有必要参考文件,例如分析证书,产品信息表,安全数据表(SDS)以及卖方提供的其他用户指南。
此外,检查质量在产品中,寻找以下几点:
- 该产品具有99%的纯度,由HPLC确认(a色谱法技术)。
- 没有e.coli或人类DNA。
- 该产品高度稳定。
市场上有一系列纯和修改形式的DGTP,可以在许多实验室测定中以及其他试剂以及包括其他DNTP(DATP,DCTP和DTTP),TRIS-HCL缓冲液,引物,DNA多聚合酶酶酶的其他试剂以及其他试剂中提供。,EDTA和其他化学底物。
通过将DGTP溶解在10 mm-50 mm的TRIS缓冲液中(由产品用户手册的指导)来制备用于实验的DGTP解决方案。
DGTP的某些应用是:
- DGTP用于多个实验室测定中,包括:
- pcr
- RT-PCR
- DNA测序
- DNA标记
- 重组DNA的分子克隆/合成
- 基因组测序
- 微阵列
- qpcr
- cDNA合成
- 定向诱变
- 远程PCR
- 基因分型
- DHPLC
- 它的类似7-deaza-dgtp,被使用体外当模板DNA富含GC含量时,测序技术以提高PCR产量。
DGTP结构
三磷酸脱氧鸟苷是三磷酸核苷,具有鸟嘌呤碱(嘌呤),三个由磷酸甘氨酸氢键和脱氧核糖糖连接的磷酸基团。脱氧核糖不包含糖环2'位置的羟基。
DGTP的CAS数为2564-35-4。该数字用于为化学物质提供唯一的识别,而不会被任何其他化合物误认为。
数字:DGTP结构的例证。
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DGTP是一种基于嘌呤的核苷酸,在DNA合成中应用。此外,它在几种生物体中充当代谢产物,并促进了某些生物学过程,例如嘌呤代谢。
该化合物还用于实验室,以执行一系列应用,例如标准PCR,远程PCR,DNA标记和测序。所有这些程序都可以帮助科学家了解生物的代谢过程,并更好地了解其生活方式。
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