脱氧鸟苷三磷酸(dGTP)是什么?
什么是dGTP?
脱氧鸟苷三磷酸(dGTP)是一种具有嘌呤碱基(鸟嘌呤)、脱氧核糖和三个磷酸基的核苷酸。它是DNA合成所需的四种dNTPs(脱氧核苷三磷酸)之一,另外还包括:
每一个脱氧核苷三磷酸,包括dGTP,形成一个磷酸二酯键,形成新的DNA链,使用DNA聚合酶和精力。
dGTP除了作为DNA复制的基石外,还在一些生物过程中作为代谢物,并在分子生物学、生物化学和生物化学中作为必要的原料03manbetx.com 执行在体外生化反应,如PCR.
dGTP也被称为2 ' -脱氧鸟苷-5 ' -三磷酸,2 ' -脱氧鸟苷三磷酸和脱氧- gtp。其分子式为C10H16N5O13P3,分子量为507.181 g/mol。
dGTP合成
dGMP作为合成dGTP的前体。该过程通过两种方法进行,要么通过酶合成,要么通过化学磷酸化。
- 酶的合成:在这个过程中,高度特异性的酶被用来进行磷酸化过程.在这个过程中没有额外的纯化步骤,所有的杂质(如焦磷酸盐和修饰的核苷酸)和PCR抑制剂(如脱氧核苷四磷酸盐)都被消除了。
- 化学磷酸化:这是在不使用酶的情况下将磷酸基添加到dGMP的过程。它需要在核苷酸生产后进行额外的纯化步骤,以消除杂质和微量化合物,如PPi、脱氧核苷二磷酸盐和其他离子化合物,如乙酸。
在这篇文章中,我们将介绍dGTP的功能,它如何执行这些功能,它的结构特征,以及它与GTP(鸟苷三磷酸)的不同之处。
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dGTP vs GTP
dGTP和GTP的区别主要在于结构方面。然而,这个参数也在功能上将它们分开。
dGTP和GTP之间的一些显著差异包括:
dGTP |
三磷酸鸟苷 |
|
1. | 它含有脱氧核糖。 |
它含有核糖。 |
2. | 其分子式为C10H16N5O13P3。 |
其分子式为C10H16N5O14P3。 |
3. | 它没有羟基 它位于糖的2 '位置。 |
它有一个羟基 它位于糖的2 '位置。 |
4. | 它是DNA复制的基本底物。 |
它是转录的重要组成部分。 |
5. | 它参与了DNA的合成。 |
它参与了RNA的合成。 |
6. | 除了参与 复制过程中,它起作用 作为某种生物的代谢物 过程,包括嘌呤代谢和硫鸟嘌呤作用途径。 |
它的功能包括能量传递 在细胞中(可以很容易地转化为ATP), 遗传翻译,不稳定性在 微管动力学,和线粒体中蛋白质的易位。 |
7. | 分子dGTP结构. | 分子GTP结构. |
dGTP是如何工作的?
dGTP含有三个磷酸基,α, β和γ磷酸。它们由高能磷酸酐键连接在一起。
当在体外DNA扩增或在活的有机体内DNA合成发生时,两个磷酸基被移除,碱基被纳入新的核酸链。
在DNA合成过程中,两个磷酸盐,α和β在反应中被去除,导致dGMP(脱氧鸟苷单磷酸)的形成。除去的PPi基团为DNA聚合酶提供能量,将即将到来的核苷酸添加到新合成的DNA链中。
dGMP的5 '磷酸基与生长链核苷酸的3 '羟基结合。这导致两个核苷酸之间形成磷酸二酯键。
dGTP的用途是什么?常见的应用程序
dGTP是一种核苷三磷酸,在生物和生物中具有广泛的作用和用途在体外实验室工作流程。
在生物
- dGTP是DNA合成的基石。
- 它是治疗HSV中抑制病毒复制开始的阿昔洛韦的竞争对手之一。
- 它也是由核糖核苷酸还原酶调节脱氧核苷酸合成的底物。
- 它作为一种代谢物在生物的几个生物过程中,包括大肠杆菌(大肠杆菌),人类,老鼠,拟南芥等等。它包括硫唑嘌呤作用途径,硫鸟嘌呤作用途径,巯基嘌呤作用途径,嘌呤代谢。
- 它作为四聚体SAMHD1脱氧核苷三磷酸三磷酸水解酶的变构激活剂。dGTP结合在酶的活性位点,导致酶的一些构象变化和激活。
在分子生物学实验室
为了进行实验室实验,一个优秀的dGTP是必不可少的,因为低质量的试剂会破坏整个工作流程。因此,有必要参考卖方提供的文件,如分析证书、产品信息表、安全数据表(SDS)和其他用户指南。
此外,检查质量对于产品,要注意以下几点:
- 产品纯度99%,经HPLC (a色谱法技术)。
- 它是免费的大肠杆菌或者人类DNA。
- 产品高度稳定。
市场上有一系列纯净和改性形式的dGTP,有助于许多实验室分析,以及其他试剂,其中包括其他dntp (dATP, dCTP和dTTP),三盐酸缓冲液,引物,DNA聚合酶酶,EDTA和其他化学底物。
实验用的dGTP溶液是通过将dGTP溶解在10 mM-50 mM的tris缓冲液中制备的(如产品用户手册所示)。
dGTP的一些应用包括:
- dGTP用于几种实验室分析,包括:
- 聚合酶链反应
- rt - pcr
- DNA测序
- DNA标签
- 重组DNA的分子克隆/合成
- 基因组测序
- 微阵列
- qPCR
- 互补脱氧核糖核酸的合成
- 定点诱变
- 远程PCR
- 基因分型
- DHPLC
- 它的模拟,7-Deaza-dGTP,用于在体外测序技术可以提高模板DNA富含GC含量时的PCR产量。
dGTP结构
脱氧鸟苷三磷酸是一种具有鸟嘌呤碱基(嘌呤)的核苷三磷酸,由磷酸酐键连接的三个磷酸基和脱氧核糖。脱氧核糖在糖环的2 '位置上不含羟基。
dGTP的CAS号为2564-35-4。这个数字是用来为化学物质提供唯一的识别,不会被任何其他化合物搞错。
图:dGTP的结构示意图。
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dGTP是一种嘌呤基核苷酸,在DNA合成中有应用。此外,它在几种生物中作为代谢物,并促进某些生物过程,如嘌呤代谢。
该化合物还用于实验室进行一系列应用,如标准PCR、远程PCR、DNA标记和测序。所有这些程序都有助于科学家了解生物体的代谢过程,并更好地了解它们的生活方式。
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